Anciennement connu sous l’appellation Direction des Services Centraux, entre 1960 et 1964 ;

   Le Secrétariat Général est placé sous l’autorité d’un Secrétaire Général, haut fonctionnaire nommé par décret du Président de la République.

   Les hauts fonctionnaires qui ont occupé cette haute fonction depuis sa mise en place :

• Monsieur YAYA GARGA, 1964-1965 ;
• Monsieur ISSA BAKARY, 1965 à 1966 ;
• Monsieur BELLO BOUBA MAIGARI, 1966-1974 ;
• Monsieur IBRAHIMA WADJIRI, 1974-1982 ;
• Monsieur Michel MEVA’A MEBOUTOU, 1982-1989 ;
• Monsieur Jean-Marie ALEOKOL, 1989-2005 ;
• Monsieur AMADOU VINDJEDOU, 2005-2016 ;
• Monsieur SAÏD KAMSOULOUM, depuis 2016 jusqu’à ce jour.

   Son organisation actuelle est régie par le Décret N° 2001/177 du 25 Juillet 2001 portant organisation du Ministère de la Défense.